CIDEIM está comprometido con el progreso científico y el bienestar de la población colombiana y de nuestros vecinos de la región.  Por su carácter autónomo dentro del Sistema Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación, CIDEIM  es un paradigma institucional que explora y abre fronteras en la investigación biomédica de enfermedades transmisibles. Nuestro equipo multidisciplinario desarrolla soluciones para problemas de salud y construye capacidad científica y tecnológica a través de investigación básica y aplicada. Para lograr nuestra misión, concertamos con los sectores de salud pública, productivo y académico a nivel nacional e internacional.

CIDEIM es un centro de investigación, desarrollo tecnológico y formación de recurso humano en el campo de la biomédicina. Su propósito es buscar alternativas para disminuir el impacto negativo y los costos de las enfermedades infecciosas.  El Centro tiene sus antecedentes en un programa de cooperación internacional entre la Universidad de Tulane y la Universidad del Valle que se estableció en 1961.  En el año 1990 CIDEIM se estableció como entidad autónoma nacional.  Lo anterior fue posible gracias al apoyo para el desarrollo institucional dado por la Organización Mundial de la Salud (OMS), el respaldo del Instituto Colombiano para el Desarrollo de la Ciencia y la Tecnología “Francisco José de Caldas” (COLCIENCIAS) y al esfuerzo del grupo de investigadores y  personal de apoyo que conformaban CIDEIM.  En este proceso fue fundamental el concurso de líderes académicos y cívicos del departamento del Valle y del país.

En CIDEIM cada área disciplinaria y cada investigador constituyen parte de un esfuerzo integral e interdependiente para lograr un mismo propósito.  Este es un  paradigma organizativo, intrínseco a la estrategia organizacional escogida,  en el cual el grupo de investigadores trabaja concomitantemente en diferentes líneas acordes con su capacidad disciplinaria.